Universitas Cokroaminoto Yogyakarta yang disingkat UCY lahir pada tanggal 28 Oktober 1984, yang merupakan pindahan Universitas Cokroaminoto di Surakarta yang telah berdiri sejak pada tanggal 28 Oktober 1955.Universitas Cokroaminoto Yogyakarta merupakan salah satu institusi pendidikan tinggi Islam, maka kegiatan-kegiatan Tri Dharma Perguruan Tinggi dan dakwah Islamiahnya berpedoman pada prinsip-prinsip Syarikat Islam. Dalam tataran pelaksanaannya, pemikiran-pemikiran HOS TJOKROMINOTO sebagai Guru Bangsa menjadi sumber inspirasi dalam mengembangkan ilmu pengetahuan guna mendukung dan menjunjung tinggi cita-cita luhur negara untuk ikut serta mencerdaskan bangsa sesuai dengan amanah Undang-Undang Dasar Negara Kesatuan Republik Indonesia tahun 1945.Untuk maksud tersebut diatas Universitas Cokroaminoto Yogyakarta selalu mengedepankan prinsip TRILOGI SYARIKAT ISLAM Yaitu : Sebersih-bersih Tauhid, Setinggi-tinggi Ilmu Pengetahuan, dan Sepandai-pandai Siyasah Akhlakul Karimah.